Genetyka i Statystyka

[GunnarSK]

Podczas studium informatyki spotkałem się z podstawami matematyki i statystyki. Statystika jest właściwie odwróconą kalkulacją prawdopodobieństwa, przyjmuje się założenie wyjściowe (hypotezę zerową), że wynik będzie zgodny z oczekiwaniami (coś konkretnego albo dystrybucja), i jeśli za bardzo odbiega od tego, jest statystycznie istotna różnica, i założenie wyjściowe się odrzuca. Kiedy jest odrzucane, zależy od założonego poziomu istotności, najczęściej 0,05 czyli 5% albo 0,01 czyli 1%. W przypadku genetyki to jest bardzo proste, bo kalkulacje prawdopodobieństwa mogą być oparte o tzw. reguły Mendela. Cechy związane z allelami recesywnimi występują tylko jeśli dany allel pochodzi od obu rodziców, czyli np. w pokoleniu F2 w 0,25 (25%), jeśli F1 był heterozygowy i doszło do samozapylenia.

[GunnarSK]

Najłatwiej wyliczyć prawdopodobieństwo pojawienie się cech zgodnych z dominującym allelem poprzes liczenie odpowiedniej (zgodnie z liczbą osobników/roślin) moci 0,75 (75%). Wtedy wiemy te, jakie jest prawdopodobieństwo "recesywnych" cech. Pierwszy raz widziałem w praktyce, jak to działa, kiedy w ogródku mamy wśród niebieskich cebulic hiszpańskich była jedna kpka/rolina z różowymi kwiatami. Tak samo chyba jest z innymi kwiatkami o tych samych kolorach: przylaszczki, czarnuszki Damasceńskie, a nie wiem, jak jest z lilakami.

[KamilT]

heterozygowy

heterozygotyczny

poza tym ok:) genetyka i hodowla są super ;/

[GunnarSK]

kolor niebieski jest dominujący nad różowym u cebulic hiszpańskich, i oba kolory są dominujące nad białym/brakiem koloru, i tak samo jest u przylaszczek i przypuszczalnie czarnuszek Damasceńskich. U pomidorów najbardziej znane cechy zależne tylko od jednego genu i podobne są: wzrost (samokończący jest recesywny, wysoki dominujący), kolor owocu (dwa geny: czerwony miąsz/RF jest dominujący, żółty/rf recesywny, żółta skórka/YS jest dominująca, biała/jasna/matowa bezkolorowa/ys recesywna), liście (regularne są dominujące, ziemniaczane recesywne). Wiele innych cech jest bardziej skomplikowanych, bo zależą od kilku genów: smak, kształt i wielkość owoców, liczba owoców i gron itp.

[GunnarSK]

Z pomocą kalkulatora http://web2.0calc.com/ (może być inny) wyliczyłem, ile trzeba roślin, żeby było mało prawdopodobne (< 0,05), że wszyskie mają cechy dominujące i żadne recesywne i żeby było bardzo nieprawdopodobne (< 0,01).
Jeśli jeden gen wchodzi w grę, cecha recesywna się pojawia w 1/4 (0,25) wszystkich przypadków, a jeśli są dwa geny, cecha recesywna się pojawia w drugiej mocy 1/4 (0,0625) wszystkich przypadków.
Liczby są takie:
(< 0,05): 11 roślin, jeśli jest jeden gen, a też jeśli dwa.
(< 0,01): 17 roślin, jeśli jest jeden gen.

[GunnarSK]

Widocznie już nie umiem używać kalkulatora, chociaż kiedyś miałem jedną na pulpicie, i nie musiałem szukać po internecie.
później wprowadzę poprawne liczby, bo nie mogą być takie same dla jednego i dwóch genów.

[GunnarSK]

Żeby z kalkulatora wyszło coś sensownego, trzeba odświeżyć/wyczyścić bufor (klawisz F5 albo funkcja "reset"), bo inaczej zostanie wartość już wprowadzona.

Poprawne liczby są takie:.

(< 0,05): 11 roślin, jeśli jest jeden gen, a 36 jeśli dwa.
(< 0,01): 17 roślin, jeśli jest jeden gen, a 47 jeśli dwa.
Z dwoma allelami recesywnymi mamy do czynienia np. jeśli chcemy pomidora koloru kremowego albo jasno żółtego (jasna skórka i żółty miąższ).