Jeśli te większe sadzonki odżyły po tych kilku dniach to musisz uważać żeby nie doszło do zbytniego przesuszenia gleby - zwiększy się stężenie nawozów. Dlatego je również przesadziłbym do nowej ziemi.

Efekt zbyt dużej ilości wody (która często też obniża temperaturę podłoża), proponuję kolejnym razem mniej podlewać i nie używać nawozów ( a jeśli już to coś sypkiego co wcześniej można sobie przygotować np. w butelce po wodzie). Małe sadzonki lepiej znoszą lekkie zaniedbanie od "nad-opiekuńczości"
Czasem przy pikowaniu pomidor całkiem stracił korzenie i wkładałam do ziemi samą łodyżkę i tak się ukorzeniała